Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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