Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ASAP1-IT2-201ENST00000626977 2031 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MAGI2-214ENST00000628781 2013 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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