Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EZH1-205ENST00000585893 2394 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NTPCR-201ENST00000366627 1762 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13A-220ENST00000513837 2590 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TKTL1-202ENST00000369915 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK1G-201ENST00000009105 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390728.1-201ENST00000397642 1941 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00909-202ENST00000580048 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RARB-203ENST00000437042 2775 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1L-203ENST00000407844 3642 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL6-212ENST00000431707 2060 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CD300LG-201ENST00000293396 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2Z1-201ENST00000324060 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV11-1-201ENST00000390367 364 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1-2-201ENST00000390594 417 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms