Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 INPP5K-203ENST00000406424 3194 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ACAP2-215ENST00000618471 3207 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH8-203ENST00000400441 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC1A7-205ENST00000620288 3378 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 POGLUT1-201ENST00000295588 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KRT31-201ENST00000251645 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRF4-201ENST00000283303 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXN4-201ENST00000299162 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HIST1H3J-201ENST00000359303 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 IGLV1-50-201ENST00000390291 405 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP9-1-201ENST00000398470 753 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GAGE10-201ENST00000407599 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079987.1-201ENST00000420181 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HM13-IT1-201ENST00000421894 356 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353572.2-201ENST00000427728 748 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PHKG1P4-201ENST00000430144 370 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007036.1-201ENST00000430537 674 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CHCHD4P4-201ENST00000437690 327 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RPSAP76-201ENST00000444599 853 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001271.1-201ENST00000445532 206 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FGF5-203ENST00000456523 5234 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KRT42P-203ENST00000458343 671 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL380P-201ENST00000461702 308 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL648P-201ENST00000478418 301 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC233964.1-201ENST00000512165 1089 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC233724.12-201ENST00000512227 594 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms