Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SRSF5Q13243 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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