Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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