Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFE2L3Q9Y4A8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFE2L3Q9Y4A8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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