Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED7Q9Y3B3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMED7Q9Y3B3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms