Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF18Q9UNG2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms