Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMCC3Q9ULS5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms