Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED23Q9ULK4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms