Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO1Q9P1Z2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO1Q9P1Z2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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