Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms