Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRMT1Q9NXH9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRMT1Q9NXH9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms