Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED9Q9NWA0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED9Q9NWA0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms