Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCAF13Q9NV06 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCAF13Q9NV06 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms