Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNTG1Q9NSN8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNTG1Q9NSN8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms