Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NADK-207ENST00000469045 890 ntTSL 515.38■□□□□ 0.054e-22■■■■■ 208.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-211ENST00000489538 475 ntTSL 314.39□□□□□ -0.114e-22■■■■■ 208.7
UTP3Q9NQZ2 NADK-209ENST00000480499 549 ntTSL 214.33□□□□□ -0.124e-22■■■■■ 208.7
UTP3Q9NQZ2 SART1-208ENST00000533386 586 ntTSL 215.88■□□□□ 0.131e-10■■■■■ 208.6
UTP3Q9NQZ2 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.766e-8■■■■■ 208.6
UTP3Q9NQZ2 MIGA2-203ENST00000439290 4345 ntTSL 215.52■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 208.5
UTP3Q9NQZ2 MIGA2-204ENST00000445183 3598 ntTSL 214.39□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 208.5
UTP3Q9NQZ2 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 208.5
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 208.5
UTP3Q9NQZ2 KPNA1-210ENST00000494339 1923 ntTSL 222.31■■□□□ 1.169e-7■■■■■ 208.4
UTP3Q9NQZ2 KPNA1-203ENST00000465882 1062 ntTSL 312.1□□□□□ -0.479e-7■■■■■ 208.4
UTP3Q9NQZ2 KPNA1-206ENST00000476916 575 ntTSL 410.07□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 208.4
UTP3Q9NQZ2 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 208.4
UTP3Q9NQZ2 KPNA1-209ENST00000493510 596 ntTSL 48.33□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 208.4
UTP3Q9NQZ2 RTF1-202ENST00000462276 485 ntTSL 411.39□□□□□ -0.594e-61■■■■■ 208.2
UTP3Q9NQZ2 RTF1-205ENST00000558298 327 ntTSL 58.4□□□□□ -1.064e-61■■■■■ 208.2
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-220ENST00000534676 915 ntTSL 220.13■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 207.8
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-218ENST00000534280 766 ntTSL 319.65■□□□□ 0.741e-8■■■■■ 207.8
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-207ENST00000527382 699 ntTSL 313.67□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 207.8
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-219ENST00000534465 779 ntTSL 313.67□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 207.8
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-212ENST00000529284 1182 ntTSL 512.32□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 207.8
UTP3Q9NQZ2 PGD-207ENST00000491493 806 ntTSL 518.24■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 207.6
UTP3Q9NQZ2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 207.5
UTP3Q9NQZ2 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 221.61■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 207.5
UTP3Q9NQZ2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 207.5
UTP3Q9NQZ2 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 207.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 520.25■□□□□ 0.837e-7■■■■■ 207.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 219.81■□□□□ 0.767e-7■■■■■ 207.3
UTP3Q9NQZ2 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 207.3
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-209ENST00000587602 3875 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.311e-6■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 SHC2-206ENST00000590222 951 ntTSL 518■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 207.1
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 207
UTP3Q9NQZ2 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 207
UTP3Q9NQZ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.438e-7■■■■■ 206.9
UTP3Q9NQZ2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 206.9
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 206.9
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 206.9
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 206.9
UTP3Q9NQZ2 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 206.8
UTP3Q9NQZ2 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 206.8
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-211ENST00000484104 725 ntTSL 221.72■■□□□ 1.073e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-214ENST00000493924 1573 ntTSL 521.11■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-210ENST00000483227 886 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.913e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-209ENST00000479508 741 ntTSL 220.18■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-216ENST00000498313 988 ntTSL 520.17■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-215ENST00000493948 641 ntTSL 319.11■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-9■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-202ENST00000339046 1202 ntTSL 217.98■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-203ENST00000407491 574 ntTSL 317.46■□□□□ 0.399e-12■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-206ENST00000446063 1262 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.363e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-204ENST00000443042 579 ntTSL 416.68■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.199e-12■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TSPAN32-208ENST00000461200 3325 ntTSL 215.95■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-215ENST00000472700 536 ntTSL 515.56■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 Z98749.2-205ENST00000457665 974 ntTSL 215.46■□□□□ 0.079e-12■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-210ENST00000435937 500 ntTSL 315.16■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-211ENST00000532927 945 ntTSL 214.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 LCMT1-201ENST00000380962 1529 ntTSL 214.23□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 TGFBR3-203ENST00000417833 551 ntTSL 414.05□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 LINC01606-209ENST00000523341 714 ntTSL 313.81□□□□□ -0.25e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-202ENST00000448981 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 LCMT1-204ENST00000564011 1168 ntTSL 511.16□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-201ENST00000265651 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 SDCCAG8-204ENST00000463042 626 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.795e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-207ENST00000530013 3740 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -12e-6■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.187e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 LCMT1-213ENST00000577157 522 ntTSL 34.05□□□□□ -1.765e-8■■■■■ 206.7
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.656e-7■■■■■ 206.6
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 206.6
UTP3Q9NQZ2 POGZ-210ENST00000476128 397 ntTSL 58.05□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 206.5
UTP3Q9NQZ2 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.474e-27■■■■■ 206.5
UTP3Q9NQZ2 VPS4A-201ENST00000254950 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 206.4
UTP3Q9NQZ2 AC026464.4-201ENST00000570054 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 206.4
UTP3Q9NQZ2 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 528.58■■■□□ 2.171e-6■■■■■ 206.4
UTP3Q9NQZ2 GAS6-205ENST00000610073 2169 ntTSL 221.58■■□□□ 1.058e-8■■■■■ 206.4
UTP3Q9NQZ2 GAS6-203ENST00000480426 2507 ntTSL 218.44■□□□□ 0.548e-8■■■■■ 206.4
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 206.2
UTP3Q9NQZ2 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 206
UTP3Q9NQZ2 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 206
UTP3Q9NQZ2 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.62e-8■■■■■ 206
UTP3Q9NQZ2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.986e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-223ENST00000590215 749 ntTSL 520.02■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 205.9
UTP3Q9NQZ2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 205.9
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