Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRC4Q9NPP4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLRC4Q9NPP4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms