Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MIXL1Q9H2W2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MIXL1Q9H2W2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms