Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL4Q9C0H6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms