Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM4Q9C037 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms