Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMES1Q9C002 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NMES1Q9C002 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms