Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A1Q9BZW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms