Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC4A5Q9BY07 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC4A5Q9BY07 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms