Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPS4Q9BT78 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPS4Q9BT78 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms