Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCGF1Q9BSM1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms