Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP1Q9BPW8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms