Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP9Q99956 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms