Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMTK3Q96Q04 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms