Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COG8Q96MW5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COG8Q96MW5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms