Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms