Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKNOX2Q96KN3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms