Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms