Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VPS50Q96JG6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms