Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALML4Q96GE6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms