Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC47Q96A33 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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