Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRF1Q92994 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRF1Q92994 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms