Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms