Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG16L2Q8NAA4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms