Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD53Q8N9V6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms