Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00612Q8N6U2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms