Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CLDN19Q8N6F1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLDN19Q8N6F1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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