Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L2Q8N4U5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L2Q8N4U5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms