Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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