Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC47Q8N1G4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC47Q8N1G4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms