Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RAB11FIP4Q86YS3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP4Q86YS3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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