Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms