Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1Q6PKG0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LARP1Q6PKG0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms