Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD1Q5T700 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms